Atualizações de taxonomia do NCBI para classificação de vírus

A partir de 28 de abril de 2025

Em dezembro de 2024, nós anunciado várias mudanças importantes na classificação do vírus no Taxonomia do NCBI banco de dados. Essas atualizações fazem parte de nossos esforços contínuos para garantir que a taxonomia viral reflita o mais recente entendimento científico e se alinha aos padrões internacionais estabelecidos pelo Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV). Começaremos a implementar essas atualizações na semana de 28 de abril de 2025.

O que esperar dessas atualizações

• Melhorias nos agrupamentos e nomes taxonômicos: Alguns táxons serão renomeados, reclassificados ou reorganizados com base em pesquisas em evolução e dados genômicos.
• Adição de novos nomes de espécies binomiais: Adicionaremos mais de 7.000 novos nomes de espécies de vírus binomiais. Os nomes de espécies anteriores serão movidos abaixo dos novos nomes na hierarquia de taxonomia.

Antigo Nomenclatura da ICTV

Novo na primavera de 2025

Por que essas mudanças são importantes?

A taxonomia precisa e atualizada do vírus é fundamental para muitos tipos de pesquisa, desde o rastreamento de surtos virais até a garantia de regulamentos adequados de segurança. Ao alinhar nosso banco de dados de taxonomia com os mais recentes padrões do ICCT, facilitamos a que os cientistas:

• Analisar sequências virais com maior precisão
• Identifique as relações entre espécies virais com mais precisão
• Melhore a consistência das atribuições taxonômicas nos conjuntos de dados, facilitando o compartilhamento e análise de dados em toda a comunidade científica global

O que isso significa para você

A partir da semana, a partir de 28 de abril, você pode notar alterações nas linhagens de vírus entre os recursos do NCBI, no entanto, os registros do GenBank permanecerão atribuídos ao mesmo organismo ao qual estão atualmente atribuídos. Como parte da atualização, também modificaremos o Virus RefSeqs para refletir a taxonomia revisada – incluindo a criação de novos refSeqs, atualizações para o organismo e títulos atribuídos em registros e atualização da anotação de genes e metadados.

Essas mudanças são especialmente relevantes para os pesquisadores de virologia usando o vírus NCBI, conjuntos de dados RefSeq, NCBI ou GenBank para envios e análises. Em particular, aqueles que usam a ferramenta de linha de comando de dados do NCBI devem atualizá-la para a versão mais recente (v18.1 ou acima) para evitar problemas de recuperação. Recomendamos revisar seus fluxos de trabalho, particularmente aqueles que envolvem envios de sequência e recuperação, ferramentas de classificação ou análises filogenéticas, para garantir que elas acomodam as classificações de vírus atualizadas. Para mais detalhes e tutoriais sobre como fazer a transição para a nova nomenclatura, fique de olho no Documentação do vírus NCBI. Nosso objetivo é tornar essas transições o mais suaves possível para a comunidade científica e criaremos e publicaremos documentação à medida que avançamos na transição.

Você pode usar o ICTV “Encontre as espécies”Ferramenta, entre em contato conosco através do NCBI HELP Deskou envie uma pergunta através do botão amarelo de “feedback” nas páginas da Web do NCBI para obter assistência para encontrar o nome e a linhagem taxonômica de um vírus.

Lembrete

Taxonomia do NCBI feita recentementemudanças de classificaçãopara o nó superior para vírus (taxid 10239). O taxid permanecerá o mesmo, mas a classificação única é alterada para “raiz acelular” de “Superkdom”. Da mesma forma, a classificação única para organismos celulares (taxid 131567) é alterada para “raiz celular” de “No Rank”.

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