Agora disponível: coleção de genoma de referência bacteriana e archaeal atualizada

Baixe a referência bacteriana e archaeal atualizada Genoma coleção! Construímos esta coleção de 21.794 genomas, selecionando a “melhor” montagem do genoma para cada espécie entre os mais de 400.000 genomas procarióticos em Refseqque é 536 mais do que foi incluído no lançamento de janeiro.

O que há de novo?

1. Como anunciado anteriormenteagora temos um processo de liberação incremental. Você pode encontrar um Arquivo de rastreamento de histórico Disponível no caminho de Assembly_reports no Ftp Site que lista o histórico da seleção de genoma de referência, incluindo procariontes e eucariotos.
2. Você pode acelerar suas pesquisas de sequência de explosão executando-as contra esses genomas de alta qualidade em vez de todos os núcleo_nt ou nr. Atualizamos o Nucleotide Blast Refseq Reference Genomes Banco de dados (quarto no menu suspenso em “Escolha o conjunto de pesquisas”), bem como o banco de dados no Página de explosão de nucleotídeo microbiana com esta coleção atualizada. Você também pode executar pesquisas de explosão contra o proteínas ANOTATADO NESTE GENOMES DE REFERÊNCIA (segundo no menu suspenso).

Os critérios para selecionar a montagem de referência “The” para uma determinada espécie, dentro de todos os assembléias disponíveis no Refseq para esta espécie, incluem contiguidade e integridade da montagem e qualidade da anotação refSeq. Veja os genomas de refseq procarióticos documentação Para detalhes.

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